تعدّ الإسكوا كل عام مذكرة للأمين العام للأمم المتحدة حول انعكاسات الاحتلال الإسرائيلي على الأحوال المعيشية للشعب الفلسطيني في الأرض الفلسطينية المحتلّة، بما فيها القدس الشرقية، وللسكان العرب في الجولان السوري المحتل.  وتنظّم أحداثاً تلقي الضوء على محن الشعب الفلسطيني، وانتهاكات إسرائيل المتواصلة للقانون الدولي وقرارات الأمم المتحدة.

وتعمل الإسكوا، بالتعاون مع شركائها الفلسطينيين والإقليميين والدوليين، على وضع استراتيجيات للتوعية بالآثار السلبية للاحتلال الإسرائيلي وعملياته العسكرية، ولتخفيف من وطأتها، وحصول الشعب الفلسطيني على حقوقه، ولا سيما الحق في تقرير المصير، وحق العودة، والحق في التنمية.  وتعمل أيضاً على بناء قدرات المؤسسات الفلسطينية، في الأراضي المحتلة وفي الخارج، وتشجّع الجهات الفاعلة الإقليمية والدولية على بناء شراكات إنمائية مع نظرائها الفلسطينيين.